・古代 進(こだい すすむ)
ヤマト艦長代理。
ガミラスとの大戦後、辺境警備を経て再びヤマトに乗艦。

・森 雪(もり ゆき)
ヤマト生活班長。
艦内の生活環境保全に気を配り、古代を限りなく愛する。

・沖田 十三(おきた じゅうぞう)
初代ヤマト艦長。
イスカンダルへの旅を成功に導き、病に散った歴戦の勇士。

・土方 竜(ひじかた りゅう)
総司令。
旗艦アンドロメダ艦長を務め白色彗星迎撃に挑む知将。

・島 大介(しま だいすけ)
ヤマト航海班長。
冷静沈着な卓越した操縦技能の持ち主。古代とは親友。

・斉藤 始(さいとう はじめ)
空間騎兵隊第11番惑星隊長。
豪放磊落な性格で、帝国動力炉と共に自爆。

・テレサ
無人星テレザートに一人で住み、白色彗星帝国の脅威を全宇宙に発信する美少女。

・デスラー
ガミラス帝国総統。
ヤマトへの復讐の鬼と化しズォーダーと連合する。

・サーベラー
帝国総参謀長。
己の保身のためなら大帝さえ欺く権力の亡者。

・ズォーダー
彗星都市帝国ガトランティス大帝。
自分が宇宙の法とおごり、破壊を続ける。

・ゴーランド
帝国軍防衛艦隊司令。
ゲーニッツ直属の部下で、極秘にデスラーの行動を監視する役割も担っていた。

・バルゼー
第6遊動機動部隊司令官。
旗艦メダルーザを操り冷徹に指揮を執る。